تضم الأقصر مجموعة من الفنادق ذات الـ3 نجوم التي تجمع بين الأسعار المعقولة والخدمات الأساسية. تتراوح أسعار الإقامة فيها عادة بين 30 و80 دولارًا لليلة، مما يجعلها خيارًا شائعًا للمسافرين الباحثين عن قيمة جيدة. تقع معظم هذه الفنادق في الضفة الشرقية قرب معبد الأقصر ومحطة القطار، مثل فندق نيفرتيتي الذي يطل مباشرة على المعبد ويتميز بتراس على السطح يقدم المشروبات والأطباق المصرية، وفندق ثيبيز الذي يوفر مسبحًا خارجيًا وإطلالات على الجبال.
من بين الخيارات البارزة أيضًا فندق جاديس الذي يضم مطبخًا في بعض الغرف ومناسب للعائلات، وفندق وندسور القريب من متحف الأقصر مع مسبحين ومطعمين. ينصح بحجز غرفة تطل على النيل أو الجبال للاستمتاع بالمناظر، كما توفر معظم الفنادق خدمة الواي فاي المجاني ووجبة إفطار جيدة. يُفضل الحجز المسبق خلال مواسم الذروة، والتحقق من توفر خدمة النقل من المطار التي تقدمها بعض الفنادق مثل فندق كوينز فالي.